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南京信帆生物:蛋白質序列分析和結構預測
更新時間:2016-05-30   點擊次數:1117次

【實驗目的】 
1、掌握蛋白質序列檢索的操作方法; 
2、熟悉蛋白質基本性質分析; 
3、熟悉基于序列同源性分析的蛋白質功能預測,了解基于motif、 結構位點、結構功能域數據庫的蛋白質功能預測; 
4、了解蛋白質結構預測。 
【實驗內容】 
1、使用Entrez或SRS信息查詢系統檢索人脂聯素 (ADIponectin)蛋白質序列; 
2、使用BioEdit軟件對上述蛋白質序列進行分子質量、氨基酸組成、和疏水性等基本性質分析; 
3、對人脂聯素蛋白質序列進行基于ncbi/Blast軟件的蛋白質同源性分析; 
4、對人脂聯素蛋白質序列進行motif結構分析; 
5、對人脂聯素蛋白質序列進行二級結構和三維結構預測。 
【實驗方法】 
1、人脂聯素蛋白質序列的檢索: 
(1)調用Internet瀏覽器并在其地址欄輸入Entrez; 
(2)在Search后的選擇欄中選擇protein; 
(3)在輸入欄輸入homo sapiens adiponectin; 
(4)點擊go后顯示序列接受號及序列名稱; 
(5)點擊序列接受號NP_004788 (adiponectin precursor; adipose most abundant gene transcript 1

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